アルファチャンネルという名前で呼ばれる情報ですが、python を使った、うまい取り出し方がわからずいろいろ試行錯誤した結果、次で OK だということが判明。業界標準の PIL を使います。
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# from PIL import Image
import Image

def extractAlpha(infile, outfile):
　im = Image.open(infile)
　if im.mode!='RGBA':
　　return False
　im.split()[3].save(outfile)
　return True
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